يستخدم لاكتشاف وقياس الخصائص الفيزيائية والكيميائية لمجموعة من الخلايا أو الجسيمات، ويستخدم الليزر كمصدر ضوئي لإنتاج الإشارات الضوئية، وتقوم بعمل قياسًا كميًا عالي الأبعاد لانتشار الضوء وخصائص الانبعاث لمئات الآلاف من الخلايا الفردية في كل عينة.